Национальный парк «Русский Север» стал полигоном для научных исследований и экспедиций из различных вузов страны практически с момента своего создания. Ботанические исследования территории, ныне занятой национальным парком, начались еще в 1884 году. Собранные растения и сейчас хранятся в гербариях Ботанического института РАН, кафедры ботаники Санкт-Петербургского госуниверситета, Череповецкого краеведческого музея.
С 1984 года эту местность частично захватил маршрут экспедиции вологодских ботаников по изучению запасов лекарственных растений. В 80-е годы Вологодским педагогическим университетом были организованы предпроектные исследования для организации национального парка совместно с Всесоюзным обществом охраны природы и органами лесоохраны.
В последние годы самую активную работу по изучению флоры парка проводили ученые из МГУ и ВГПУ. Особенно детально были исследованы памятники природы. Итогом этой работы стал выход в этом году в серии «Флора и фауна национальных парков» издания «Сосудистые растения национального парка «Русский Север», которое адресовано специалистам в области охраны природы и заповедного дела, а также ботаникам, флористам.
В нем дан полный перечень найденных и определенных видов сосудистых растений национального парка, который составил 720 видов из 93 семейств. Это составляет 67% от флоры всей Вологодской области. Ботанические исследования подтвердили уникальность территории «Русского Севера», ее богатый видовой состав, наличие большого количества редких и охраняемых растений.
В настоящее время изучение флоры и фауны парка продолжается. Экспедиции из Вологодского и Московского педагогических университетов уже начали новый полевой сезон.